Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX58Q96C10 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms