Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX21Q969T3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX21Q969T3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms