Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERCC4Q92889 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms