Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
TOPBP1Q92547 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOPBP1Q92547 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms