Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATRIPQ8WXE1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms