Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL22A1Q8NFW1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms