Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LRRN4CLQ8ND94 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LRRN4CLQ8ND94 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms