Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APCDD1LQ8NCL9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms