Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZIC4Q8N9L1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZIC4Q8N9L1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms