Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHCHD4Q8N4Q1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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