Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYCP3Q8IZU3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms