Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMYD4Q8IYR2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMYD4Q8IYR2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms