Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4DQ86TL0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms