Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO2Q7Z6W1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO2Q7Z6W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms