Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRINP3Q76B58 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRINP3Q76B58 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms