Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFX8Q6ZV50 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms