Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP12Q6UXS9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms