Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A10Q6U841 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A10Q6U841 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms