Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC171Q6TFL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC171Q6TFL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms