Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC174Q6PII3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC174Q6PII3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms