Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC62Q6P9F0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms