Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EDC4Q6P2E9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms