Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms