Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NANOGP8Q6NSW7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms