Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RCSD1Q6JBY9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCSD1Q6JBY9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms