Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDE2Q6IQ49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms