Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ANKRD40Q6AI12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms