Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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