Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHIC1Q5VXU3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms