Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF18Q5VWM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms