Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms