Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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LRRC38Q5VT99 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LRRC38Q5VT99 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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