Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
OBSCNQ5VST9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms