Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDSS1Q5T2R2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDSS1Q5T2R2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PDSS1Q5T2R2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDSS1Q5T2R2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDSS1Q5T2R2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms