Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms