Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFHC1Q5JVL4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFHC1Q5JVL4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms