Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms