Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ALFQ53S48 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALFQ53S48 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms