Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSD17B12Q53GQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms