Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL12Q53G59 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL12Q53G59 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms