Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYTL3Q4VX76 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms