Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DUSP28Q4G0W2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUSP28Q4G0W2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms