Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
KRTAP20-1Q3LI63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms