Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL24A1Q17RW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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