Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLPPQ16740 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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