Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CSRP2Q16527 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms