Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC6Q16204 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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