Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITSN1Q15811 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITSN1Q15811 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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