Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms