Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms